看得见的器官组织和看不见的微生物构成了形态完整、功能完善的人体。研究显示，一个成年人的微生物与自身细胞数量比值接近1:1，仅肠道微生物重量就达到1.5kg，可见种类繁多的肠道菌群构成了维系肠道健康的微生态。肠道菌群与人类健康密切相关，因此肠道微生物又被称为人的“第二基因组”。

为了探秘肠道微生物的微观世界，2021年12月16日来自复旦大学类脑智能科学与技术研究院的赵兴明教授做客欧洲杯竞猜平台临床研究中心第25期“聚菁荟萃”临床研究精品论坛并讲授了“AI赋能的微生物组学数据挖掘”的专题讲座，带领大家开启了一趟生动有趣的肠道微观之旅。

在讲座中，赵兴明教授指出针对菌群的宏基因测序是揭示人体肠道微生物的有效手段，而宏基因组的组装则是下游分析的关键，因此确保正确及时识别宏基因组装错误并进行校正成为了所有环节中的重中之重。为了解决这一问题，赵教授率领团队开发了metaMIC这一工具，利用metaMIC，使得科研团队可以基于映射结果提取特征，识别包含组装错误的contig并对组装错误位点进行识别及校正。作为一款应用高效的工具，metaMIC不仅能够以高准确率定位错误位点，而且有助于binning以及scaffolding的质量提升。同时，赵教授还介绍了另一款基于半监督的binning算法的SemiBin，通过SemiBin可以助力获得更多高质量的基因组，为后续分析工作提供便捷。得益于这两个工具，赵教授团队对中国健康人群的肠道真菌结构作了一系列研究分析，发现了肠道真菌与细菌多样性之间的关联，不仅如此，还进一步探索了真菌“肠型”与细菌“肠型”之间的联系，揭示了健康人群中的肠道真菌结构和三种真菌肠型，而基于肠道菌群的探索，也由此发现了两种自闭症亚型，为后续深入探究肠-脑关联奠定基础。

通过赵兴明教授的讲述，令与会者对于肠道菌群、微生物生态结构失调所造成的各种健康问题都有了更好理解，也对后续探索合作建立了信心。

（文：顾雯韵；图：顾雯韵）