近日Nature Communications上报道了一项与肝癌相关的lncRNA研究。清华大学联合上海东方肝胆医院研究人员收集了20个临床病人的60个样本进行了全转录组的RNA测序。其中，每个病人分别收集原发灶、临近的正常组织以及PVTT样本。一共鉴定到了20345个蛋白编码基因，13870个GencodeV19鉴定的lncRNA以及8603个新的lncRNA。其中917个lncRNA在TCGA数据库以及发表的肝癌数据库中有关联，235个lncRNA存在CNVs和DNA甲基化变化。很多与lncRNA共表达的基因富集在细胞粘着、免疫反应以及代谢过程等通路上。HAND2-AS1还通过RNAi的敲降进行了部分功能研究。
原文链接：http://www.nature.com/articles/ncomms14421