个人简介
刘宁宁 研究员/博士生导师
博士毕业于中国科学院上海生命科学研究院；在哈佛大学欧洲杯竞猜平台从事博士后研究，之后进入欧洲杯竞猜平台公共卫生学院工作，任研究员/博士生导师，同时担任欧洲杯竞猜平台单细胞组学与疾病研究中心主任助理。主要聚焦真菌感染与癌症发展分子机制研究，从真菌-宿主相互作用角度揭示真菌感染及调控癌症发生发展的分子机制，为防治真菌感染及癌症提供新靶标和新策略。在Nature Microbiology, Nature Protocols, Cell Research, PNAS, Nature Communications等杂志以第一/通讯(含共同)作者发表论文27篇，授权发明专利4项，主持国家重点研发计划课题、国自然面上和青年等项目。
学术任职
美国医学真菌学会会员、中华预防医学会卫生毒理分会青年委员、上海市预防医学会卫生检验专委会副主任委员、上海市免疫学会感染免疫专委会秘书和委员及多个期刊编委。
奖励荣誉
上海市优秀学术带头人（青年）
社会任职
上海市青联第十二届委员会委员
研究领域：真菌感染与癌症发展
真菌微生物组是人体微生物组的重要组成部分，所占比例不到1%，但真菌群落在人体健康与疾病状态中扮演着关键角色。近年来随着高通量测序技术的广泛应用，人体不同部位如口腔、肺部、消化道、阴道以及皮肤真菌组的结构和组成被解析，其在人体健康和疾病中的重要功能也逐渐被揭示。同时，人体真菌微生物组对细菌微生物组乃至病毒组的组成也有影响，是维持微生物组结构和代谢功能稳定的关键物种，真菌组对宿主的免疫应答作用也对某些疾病的发生发展有显著影响。
最新研究表明，真菌普遍存在于人类肿瘤中，这一发现应促使我们更好地探索其潜在影响，并通过‘微生物组视角’重新审视我们对癌症的几乎所有认知。因此，我们的科学问题就是：真菌如何进入肿瘤？如何在肿瘤内生存、定植并和肿瘤组织共存？真菌和细菌如何相互作用维持肿瘤微环境？回答该问题可能带来重大的变革，不仅是癌症检测方面，也包括在与药物开发、癌症演变、微小残留病灶、复发和辅助诊断有关的其他生物技术应用方面。
代表性论文
(1) Liu NN, Jiao N, Tan JC, Wang Z, Wu D, Wang AJ, Chen J, Tao L, Zhou C, Fang W, Cheong IH, Pan W, Liao W, Kozlakidis Z, Heeschen C, Moore GG, Zhu L, Chen X, Zhang G, Zhu R, Wang H. Multi-kingdom microbiota analyses identify bacterial-fungal interactions and biomarkers of colorectal cancer across cohorts. Nat Microbiol. 2022 Feb;7(2):238-250. doi: 10.1038/s41564-021-01030-7. Epub 2022 Jan 27. PMID: 35087227; PMCID: PMC8813618.
(2) Wang Y, Zhou J, Zou Y, Chen X, Liu L, Qi W, Huang X, Chen C, Liu NN. Fungal commensalism modulated by a dual-action phosphate transceptor. Cell Rep. 2022 Jan 25;38(4):110293. doi: 10.1016/j.celrep.2021.110293. PMID: 35081357.
(3) Wu Y, Jiao N, Zhu R, Zhang Y, Wu D, Wang AJ, Fang S, Tao L, Li Y, Cheng S, He X, Lan P, Tian C, Liu NN, Zhu L. Identification of microbial markers across populations in early detection of colorectal cancer. Nat Commun. 2021 May 24;12(1):3063. doi: 10.1038/s41467-021-23265-y. PMID: 34031391; PMCID: PMC8144394. (Co-corresponding author)
(4) Yi S, Liu NN, Hu L, Wang H, Sahni N. Base-resolution stratification of cancer mutations using functional variomics. Nat Protoc. 2017 Nov;12(11):2323-2341. doi: 10.1038/nprot.2017.086. Epub 2017 Oct 5. PMID: 28981122; PMCID: PMC6145840. (# Co-first author)
(5) Liu NN, Ma Q, Ge Y, Yi CX, Wei LQ, Tan JC, Chu Q, Li JQ, Zhang P, Wang H. Microbiome dysbiosis in lung cancer: from composition to therapy. NPJ Precis Oncol. 2020 Dec 10;4(1):33. doi: 10.1038/s41698-020-00138-z. PMID: 33303906; PMCID: PMC7730185.
(6) Liu NN, Acosta-Zaldívar M, Qi W, Diray-Arce J, Walker LA, Kottom TJ, Kelly R, Yuan M, Asara JM, Lasky-Su JA, Levy O, Limper AH, Gow NAR, Köhler JR. Phosphoric Metabolites Link Phosphate Import and Polysaccharide Biosynthesis for Candida albicans Cell Wall Maintenance. mBio. 2020 Mar 17;11(2):e03225-19. doi: 10.1128/mBio.03225-19. PMID: 32184254; PMCID: PMC7078483.
(7) Liu NN, Uppuluri P, Broggi A, Besold A, Ryman K, Kambara H, Solis N, Lorenz V, Qi W, Acosta-Zaldívar M, Emami SN, Bao B, An D, Bonilla FA, Sola-Visner M, Filler SG, Luo HR, Engström Y, Ljungdahl PO, Culotta VC, Zanoni I, Lopez-Ribot JL, Köhler JR. Intersection of phosphate transport, oxidative stress and TOR signalling in Candida albicans virulence. PLoS Pathog. 2018 Jul 30;14(7):e1007076. doi: 10.1371/journal.ppat.1007076. PMID: 30059535; PMCID: PMC6085062.
