新冠病毒的传播对全球健康带来了不可忽视的威胁,截至WHO最新数据,全球超过5亿人口曾感染新冠病毒,造成600多万死亡病例。各国科研人员从不同专业角度开展各项研究以期对新冠病毒本身及防治有更全面的认识。从遗传学角度来看,新冠与其他疾病是否有关联一直是被广泛关注的课题。来自OpenSAFELY的一项大型研究显示,17278392名成年人中有10926例新冠死亡病例,其中自身免疫性疾病被认为与新冠死亡高风险呈相关性;另一项meta分析纳入了102项研究,64503名患者,发现新冠患者中有较高的静脉栓塞发生率,其中,静脉栓塞发病率在新冠病例中占14.7%,在因新冠入住ICU的重症病例中占23.2%。这些研究提示科研人员,新冠病毒与类风湿性关节炎(RA)、红斑狼疮(SLE)等自免性疾病及静脉栓塞(VTE)之间存在着某种关联。目前这4种疾病都已进行过大规模的全基因组分析,但文献中缺乏相关证据证明RA、SLE、VTE与新冠之间的关联。
2022年6月2日,来自香港大学的刘中华教授受邀做客欧洲杯竞猜平台临床研究中心“聚菁荟萃”临床研究论坛,带来主题为“Genome-wide cross-trait analysis of COVID-19 with rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus and venous thromboembolism”的讲座,通过GWAS探讨多个性状之间的关联。
刘教授团队分别采集新冠、RA、SLE及VTE的病例数据并将每个病种分别设置了病例组和健康组进行对照。其中,新冠病例组根据疾病程度分为3类:A2为新冠重症病例,即入住ICU、经呼吸机辅助呼吸及死亡病例;B2为一般新冠住院病例;C2为新冠轻症或无症状感染者,即核酸检测阳性。团队应用LDSC分析方法,根据染色体上的SNP功能分组研究新冠与其他3种疾病的遗传相关性;通过MTGA分析,对病种间是否共享基因,是否在特定组织中有富集及表达通路进行深入研究;利用孟德尔随机化,探讨疾病在流行病学上的因果关系。结果发现,在保留区域染色体片段变化很少,提示RA与新冠住院、感染病例间存在遗传学相关性,并且发现RA与新冠的一些共同位点,最显著的来自于MHC Region,在肺部、脾脏、血液等发现组织富集。上述结果在VTE与新冠之间也有类似发现。研究还提示,如患者有RA病史,那么感染新冠后更有可能成为重症患者;如患者有SLE病史,则感染新冠后有可能入院,但显著性并不是特别高;如患者有VTE病史,则感染新冠可能性较大。反之,如果是新冠重症或住院患者,后期则有可能导致RA、SLE、VTE的发生。
虽然该研究因来源于欧洲患者的数据,结果仅适用于欧洲人群,并且数据未考虑新冠病毒迭代毒株变异、疫苗注射等情况,刘教授团队的研究成果仍然从全基因组多性状分析的角度又为我们捕捉了新冠病毒的另一侧面,为今后进一步深入研究提供了有效指引。